شناسايي مولكولي باكتري هاي جنس استرپتومايسس مولد مواد ضد باكتريايي از خاك هاي استان آذربايجان شرقي

چکیده

زمينه واهداف‌: اكتينوميسيت‌ها باكتري هايي گرم مثبت و رشته اي هستند كه بخش بزرگي از ميكروارگانيسم هاي خاك را شامل مي‌شوند. بر اساس مطالعات، سه چهارم كل آنتي‌بيوتيك‌ها را اكتينو‌ميسيت‌ها توليد مي‌كنند. در اين خانواده، جنس استرپتومايسس از اهميت خاص دارد. در همين راستا غربالگري براي فعاليت ضدباكتريايي و نيز شناسايي مولكولي استرپتومايسس‌هاي جدا شده از خاك‌هاي استان آذر‌بايجان شرقي با استفاده از ژن 16SrDNA انجام شد. مواد و روش‌ها‌: اكتينوميست‌ها از نمونه خاك‌هاي استان آذربايجان‌شرقي جدا‌سازي شد، غربالگري اوليه به روش تست دولايه (Bilayer) در مقابل ميكروارگانيسم هاي آزمايشي E. coli ATCC 1399, K. pneumoniae ATCC 1290, S. flexneri ATCC 1234, L. monocytogenes ATCC 33090, B. cereus ATCC 1431, Y. enterocolitica ATCC35669, and S. aureus ATCC29213 و غربالگري ثانويه، با استفاده از متابوليتهاي استخراجي ايزوله‌هاي فعال گزينش اوليه در مقابل همان ميكروارگانيسم ها با روش انتشار در آگار(Disk Diffusion Method) بررسي شدند. جهت شناسايي مولكولي، ابتدا، DNA ژنوميك از باكتري‌هاي منتخب استخراج، وژن 16SrDNA اين ايزوله تكثير و توالي يابي شد. نتايج حاصل با استفاده از برنامه هاي بيوانفورماتيك آناليز شده وايزوله هاي مذكور شناسايي شدند. يافته ها‌: از 110 نمونه خاك جمع آوري شده‌، 310 ايزوله اكتينوميست جدا سازي شد، درغربالگري اوليه، 44 ايزوله فعاليت ضد باكتريايي نشان دادند كه از اين تعداد 12 ايزوله در گزينش ثانويه بررسي شدند. نتايج توالي يابي نشان داد، ايزولهSC91 با97% به Streptomyces sampsonii‌، سويه SG41 با 96% به Streptomyces mediolani و سويه SE45 با99% به Streptomyces albogriseolus شباهت دارد. ايزوله اخير تحت نامStreptomyces albogriseolus strain ABRIINW EA1145 در NCBI با كد رهگيري GQ925802ثبت شد. نتيجه گيري‌: نتايج اين تحقيق نشان مي‌دهد خاك‌هاي استان آذر بايجان شرقي غني از ايزوله‌هاي فعال در زمينه توليد مواد آنتي‌باكتريايي جديدي بوده كه نيازمند بررسي‌هاي بيشتري است.